Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E1P51965 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms