Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRCA2P51587 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRCA2P51587 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCA2P51587 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCA2P51587 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRCA2P51587 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRCA2P51587 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCA2P51587 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCA2P51587 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCA2P51587 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCA2P51587 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCA2P51587 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCA2P51587 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCA2P51587 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCA2P51587 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCA2P51587 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCA2P51587 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms