Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCAMP50895 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BCAMP50895 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BCAMP50895 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BCAMP50895 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BCAMP50895 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCAMP50895 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCAMP50895 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms