Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms