Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ME1P48163 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ME1P48163 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ME1P48163 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ME1P48163 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ME1P48163 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms