Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms