Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFMP43652 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFMP43652 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AFMP43652 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AFMP43652 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AFMP43652 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AFMP43652 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AFMP43652 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AFMP43652 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AFMP43652 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AFMP43652 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AFMP43652 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms