Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF9P41273 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF9P41273 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms