Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms