Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KDM5CP41229 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms