Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP214P35658 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NUP214P35658 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NUP214P35658 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NUP214P35658 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUP214P35658 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms