Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTPDP35247 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms