Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF2P35240 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF2P35240 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF2P35240 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF2P35240 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF2P35240 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF2P35240 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF2P35240 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF2P35240 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF2P35240 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF2P35240 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF2P35240 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF2P35240 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF2P35240 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF2P35240 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NF2P35240 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NF2P35240 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NF2P35240 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NF2P35240 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF2P35240 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF2P35240 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms