Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD10P28358 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms