Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-DMAP28067 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms