Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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