Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms