Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALB2P22676 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALB2P22676 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALB2P22676 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALB2P22676 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALB2P22676 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALB2P22676 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALB2P22676 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALB2P22676 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALB2P22676 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALB2P22676 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALB2P22676 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALB2P22676 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALB2P22676 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CALB2P22676 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALB2P22676 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALB2P22676 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALB2P22676 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALB2P22676 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALB2P22676 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALB2P22676 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CALB2P22676 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALB2P22676 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALB2P22676 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALB2P22676 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms