Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL1P22362 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL1P22362 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCL1P22362 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL1P22362 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL1P22362 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL1P22362 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL1P22362 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL1P22362 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL1P22362 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL1P22362 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL1P22362 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL1P22362 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms