Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCP20941 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCP20941 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCP20941 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCP20941 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCP20941 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCP20941 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCP20941 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCP20941 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms