Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD53P19397 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD53P19397 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms