Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF3P18847 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF3P18847 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF3P18847 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF3P18847 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF3P18847 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF3P18847 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF3P18847 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF3P18847 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF3P18847 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms