Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTLA4P16410 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTLA4P16410 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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