Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFAP15692 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms