Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC130P13994 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms