Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYL1P12980 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYL1P12980 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYL1P12980 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYL1P12980 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYL1P12980 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYL1P12980 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYL1P12980 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYL1P12980 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LYL1P12980 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYL1P12980 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYL1P12980 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYL1P12980 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYL1P12980 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms