Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP1P11387 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP1P11387 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP1P11387 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP1P11387 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP1P11387 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP1P11387 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms