Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAMC1P11047 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms