Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP1P09874 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARP1P09874 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARP1P09874 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP1P09874 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms