Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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PTPRCP08575 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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