Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NGFRP08138 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NGFRP08138 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NGFRP08138 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms