Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPBP07199 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPBP07199 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPBP07199 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPBP07199 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPBP07199 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPBP07199 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPBP07199 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPBP07199 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPBP07199 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPBP07199 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms