Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHBP07195 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHBP07195 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDHBP07195 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHBP07195 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms