Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB3P05106 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB3P05106 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms