Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PF4P02776 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PF4P02776 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PF4P02776 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PF4P02776 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms