Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C6orf47O95873 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms