Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAP4K4O95819 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms