Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX58O95786 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX58O95786 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX58O95786 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
DDX58O95786 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX58O95786 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms