Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POP4O95707 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POP4O95707 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POP4O95707 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POP4O95707 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POP4O95707 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POP4O95707 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POP4O95707 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POP4O95707 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POP4O95707 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POP4O95707 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POP4O95707 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POP4O95707 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POP4O95707 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POP4O95707 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POP4O95707 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POP4O95707 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POP4O95707 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POP4O95707 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POP4O95707 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms