Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR1AO95602 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms