Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE8BO95263 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms