Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX4O95219 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX4O95219 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX4O95219 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX4O95219 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX4O95219 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX4O95219 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX4O95219 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX4O95219 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX4O95219 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX4O95219 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms