Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN7O94888 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms