Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCNKO75909 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCNKO75909 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNKO75909 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCNKO75909 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCNKO75909 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCNKO75909 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms