Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH16O75452 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH16O75452 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH16O75452 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH16O75452 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH16O75452 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH16O75452 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH16O75452 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH16O75452 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH16O75452 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH16O75452 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH16O75452 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH16O75452 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH16O75452 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH16O75452 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms