Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSO75390 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSO75390 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSO75390 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSO75390 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSO75390 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms