Protein–RNA interactions for Protein: O75340

PDCD6, Programmed cell death protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6O75340 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDCD6O75340 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDCD6O75340 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms