Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms