Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTNSO60931 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNSO60931 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNSO60931 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNSO60931 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNSO60931 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNSO60931 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNSO60931 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNSO60931 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNSO60931 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNSO60931 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNSO60931 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNSO60931 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNSO60931 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNSO60931 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms