Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAK2O60296 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK2O60296 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms